FAQ_Errors

Alors que si on load le module python en dernier, auucun signalement mais le conflit exitse bien et on le retrouve sur "nf-config --includedir"

Il faudrait mettre un test pour les modules qui se loadent avec un conflit (pour le .bashrc et pour pulsation)

IRENE-AMD / Error compilation (g)make: m2c: Command not found

jobcomp plante sur la première routine PISCES, et plus exactement sur la première routine qui n'est pas dans OCEAN.
jobcomp lancé depuis le répertoire OCEAN (ce qui ne se fait pas normalement!) avec la syntaxe d'origine :
SOURCE=../croco/OCEAN
trouve au début les routines qui sont dans OCEAN. Mais dès qu'il en cherche ailleurs, il ne les trouve pas.

on voit d'ailleurs en première ligne de compilation l'erreur suivante qui indique bien que le PATH SOURCE n'est pas bon mais le message passe trop vite...
cp: cannot stat ‘../croco/OCEAN/../PISCES/namelist_pisces*’: No such file or directory

Il faudrait mettre un test avec un message explicite si SOURCE ne pointe pas sur un répertoire croco (qui contienne bien la liste des répetoires OCEAN, PISCES, CVTK...)

Problème Execution croco

IRENE/ Error execution XIOS - module gcc

mpif90 -check bounds -fpe0 -traceback -g -O0 -ftrapuv -72 -fno-alias -i4 -r8 -fp-model precise -mcmodel=medium -IAGRIF -I/ccc/work/cont005/gen1140/hourdinc/wd/ASAP2/exp/datarmor2/compile/xios/XIOS_X64_IRENE_trunk_r2219-2021_09_06/inc  -o a.out par_pisces.o ocean2pisces.o trc.o sms_pisces.o p4zche.o p4zint.o p4zlys.o p4zflx.o p4zlim.o p4zsink.o p4zmicro.o p4zmeso.o p4zmort.o p4zopt.o p4zprod.o p4zrem.o p4zsbc.o p4zsed.o trcwri_pisces.o p4zagg.o p4zfechem.o p4zligand.o p4zpoc.o p4zsms.o p5zlim.o p5zmeso.o p5zmicro.o p5zmort.o p5zprod.o p4zbio.o trcsms_pisces.o trcini_pisces.o pisces_ini.o oce_sed.o par_sed.o sedadv.o sedarr.o sedbtb.o sedchem.o sedco3.o seddiff.o seddsr.o seddta.o sed.o sedini.o sedinitrc.o sedinorg.o sedmat.o sedmbc.o sedmodel.o sed_oce.o sedorg.o sedrst.o sedsfc.o sedstp.o sedwri.o setavg_sed.o module_parameter_oa.o module_oa_time.o module_oa_space.o module_oa_periode.o module_oa_variables.o module_oa_type.o module_oa_stock.o module_oa_level.o module_oa_interface.o module_oa_upd.o croco_oa.o var_oa.o tooldatosec.o toolsectodat.o tooldecompdat.o main.o step.o read_inp.o timers_roms.o init_scalars.o init_arrays.o set_weights.o set_scoord.o ana_grid.o setup_grid1.o setup_grid2.o set_nudgcof.o ana_initial.o analytical.o zonavg.o step2d.o u2dbc.o v2dbc.o zetabc.o obc_volcons.o pre_step3d.o step3d_t.o step3d_uv1.o step3d_uv2.o prsgrd.o rhs3d.o set_depth.o omega.o uv3dmix.o uv3dmix_spg.o t3dmix.o t3dmix_spg.o hmix_coef.o wetdry.o u3dbc.o v3dbc.o t3dbc.o step3d_fast.o step3d_w.o rhs3d_w_nh.o initial_nbq.o grid_nbq.o unbq_bc.o vnbq_bc.o wnbq_bc.o rnbq_bc.o w3dbc.o nbq_bry_store.o rho_eos.o ab_ratio.o alfabeta.o ana_vmix.o bvf_mix.o lmd_vmix.o gls_mixing.o lmd_skpp.o lmd_bkpp.o lmd_swfrac.o lmd_wscale.o diag.o wvlcty.o checkdims.o grid_stiffness.o bio_diag.o setup_kwds.o check_kwds.o check_srcs.o check_switches1.o check_switches2.o debug.o param.o ncscrum.o scalars.o output.o put_global_atts.o nf_fread.o nf_fread_x.o nf_fread_y.o nf_read_bry.o get_date.o lenstr.o closecdf.o insert_node.o fillvalue.o nf_add_attribute.o set_cycle.o def_grid_2d.o def_grid_3d.o def_his.o def_rst.o def_diags.o def_diagsM.o def_bio_diags.o wrt_grid.o wrt_his.o wrt_avg.o wrt_rst.o wrt_diags.o wrt_diags_avg.o wrt_diagsM.o wrt_diagsM_avg.o wrt_bio_diags.o wrt_bio_diags_avg.o set_avg.o set_diags_avg.o set_diagsM_avg.o set_bio_diags_avg.o def_diags_vrt.o wrt_diags_vrt.o set_diags_vrt.o set_diags_vrt_avg.o wrt_diags_vrt_avg.o def_diags_ek.o wrt_diags_ek.o set_diags_ek.o set_diags_ek_avg.o wrt_diags_ek_avg.o def_diags_pv.o wrt_diags_pv.o set_diags_pv.o set_diags_pv_avg.o wrt_diags_pv_avg.o def_diags_eddy.o set_diags_eddy_avg.o wrt_diags_eddy_avg.o def_surf.o wrt_surf.o set_surf_avg.o wrt_surf_avg.o get_grid.o get_initial.o get_vbc.o get_wwave.o get_tclima.o get_uclima.o get_ssh.o get_sss.o get_smflux.o get_stflux.o get_srflux.o get_sst.o mod_tides_mas.o tidedata.o mas.o get_tides.o clm_tides.o get_bulk.o bulk_flux.o get_bry.o get_bry_bio.o sstskin.o get_psource.o get_psource_ts.o cfb_stress.o mrl_wci.o wkb_wwave.o wkbbc.o get_bry_wkb.o online_bulk_var.o online_get_bulk.o online_interp.o online_interpolate_bulk.o online_set_bulk.o init_floats.o wrt_floats.o step_floats.o rhs_floats.o interp_rho.o def_floats.o init_arrays_floats.o random_walk.o get_initial_floats.o init_sta.o wrt_sta.o step_sta.o interp_sta.o def_sta.o init_arrays_sta.o biology.o o2sato.o sediment.o bbl.o MPI_Setup.o MessPass2D.o MessPass3D.o exchange.o autotiling.o zoom.o update2D.o set_nudgcof_fine.o zoombc_2D.o zoombc_3D.o uv3dpremix.o t3dpremix.o update3D.o zoombc_3Dfast.o Agrif2Model.o send_xios_diags.o cpl_prism_define.o cpl_prism_put.o cpl_prism_init.o cpl_prism_get.o cpl_prism_getvar.o cpl_prism_grid.o -LAGRIF -lagrif -L/ccc/products/ccc_users_env/compil/Atos_7__x86_64/netcdf-fortran-4.4.4/intel--19.0.5.281__openmpi--4.0.1/hdf5__parallel/lib -lnetcdff -L/ccc/products/ccc_users_env/compil/Atos_7__x86_64/netcdf-c-4.6.0/intel--19.0.5.281__openmpi--4.0.1/hdf5__parallel/lib -L/ccc/products/ccc_users_env/compil/Atos_7__x86_64/hdf5-1.8.20/intel--19.0.5.281__openmpi--4.0.1/parallel/lib -lnetcdf -lnetcdf -liomp5 -lpthread /ccc/work/cont005/gen1140/hourdinc/wd/ASAP2/exp/datarmor2/compile/xios/XIOS_X64_IRENE_trunk_r2219-2021_09_06/lib/libxios.a -lstdc++ -lnetcdff
/ccc/work/cont005/gen1140/hourdinc/wd/ASAP2/exp/datarmor2/compile/xios/XIOS_X64_IRENE_trunk_r2219-2021_09_06/lib/libxios.a(icaxis.o): In function `cxios_axis_handle_create':
icaxis.cpp:(.text+0x74): undefined reference to `std::__cxx11::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> >::_M_append(char const*, unsigned long)'
icaxis.cpp:(.text+0x88): undefined reference to `std::__cxx11::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> >::find_first_not_of(char, unsigned long) const'
icaxis.cpp:(.text+0xa4): undefined reference to `std::__cxx11::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> >::find_last_not_of(char, unsigned long) const'
icaxis.cpp:(.text+0xc8): undefined reference to `std::__throw_out_of_range_fmt(char const*, ...)'
icaxis.cpp:(.text+0x122): undefined reference to `std::__cxx11::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> >::_M_create(unsigned long&, unsigned long)'
icaxis.cpp:(.text+0x23a): undefined reference to `std::__cxx11::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> >::_M_assign(std::__cxx11::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> > const&)'
icaxis.cpp:(.text+0x45d): undefined reference to `std::__cxx11::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> >::_M_replace(unsigned long, unsigned long, char const*, unsigned long)'
icaxis.cpp:(.text+0x558): undefined reference to `std::__cxx11::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> >::_M_append(char const*, unsigned long)'
icaxis.cpp:(.text+0x677): undefined reference to `std::__cxx11::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> >::_M_assign(std::__cxx11::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> > const&)'
icaxis.cpp:(.text+0x7ce): undefined reference to `std::basic_ostream<char, std::char_traits<char> >& std::operator<< <char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> >(std::basic_ostream<char, std::char_traits<char> >&, std::__cxx11::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> > const&)'

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Problème compilation croco

IRENE-AMD / Error compilation partit.F - problème ordre module load

IRENE-AMD / Error compilation (g)make: m2c: Command not found

Problème Execution croco

IRENE/ Error execution XIOS - module gcc